純種肉牛主要包括親緣繁育(近交)和晶系育種兩個方面。
親緣繁育:親緣繁育是指有親緣關系的公母牛間的交配組合。近交也稱近親繁殖。反映近親程度的參數是近交系數和親緣系數。近交系數是表示雜合基因比例降低的一個度量。親緣繁育既能使某些優良基因純化,也能使某些隱性不利基因純合而暴露出來,表現為不良性狀而成為不良個體,如體格變小、體質變弱、生產性能降低、畸形發育等。防止近交衰退的方法是:一是近親交配只用1次或2次,然后用中親或遠親交配,以保持其優良性狀;二是嚴格選擇,防止有共同缺點的公母牛交配;三是嚴格淘汰那些突變型和重新結合的純合劣質基因型的不良個體。